More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3588 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  73.24 
 
 		 433 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 446 aa  927    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  53.69 
 
 		 445 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  52.67 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  53.13 
 
 		 445 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  52.02 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  49.89 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  53.85 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  48.76 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  46.51 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  47.2 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  44.94 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  45.1 
 
 		 513 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  38.17 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.51 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  24.88 
 
 		 358 aa  73.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 322 aa  73.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 		 298 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.16 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 873 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  27.07 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.35 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 367 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  33.73 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  29.23 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  29.39 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  30.81 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.17 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.17 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.65 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.94 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  24.01 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  32.7 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  26.96 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.3 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.11 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.82 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  27.21 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0471  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.34 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.46 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.16 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  27.96 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 319 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.95 
 
 		 338 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.05 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.57 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.54 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.82 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.2 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.05 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.75 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.63 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.22 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.71 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.54 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.08 
 
 		 330 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24.52 
 
 		 379 aa  57  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 359 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.67 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.3 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.34 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 347 aa  56.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.5 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.29 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>