More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0506 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  645    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  30.03 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  30.38 
 
 		 284 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  26.97 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  29.34 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 340 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 351 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 351 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  24.22 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 356 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  24.35 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 		 873 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  24.92 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  24.84 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.49 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.72 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  22.19 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  25.17 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  28.24 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.16 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  23.94 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2353  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.72 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  24.21 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.53 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  24.64 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.52 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.1 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  24.87 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 434 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.58 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.61 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.67 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  23.77 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.58 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  24.19 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.16 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.31 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.45 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.91 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 411 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  24.06 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.22 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 394 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  21.31 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.3 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.48 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 496 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.37 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  26.79 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>