276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3252 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 313 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  55.99 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  34.11 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.13 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  25.62 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 355 aa  85.9  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  35.4 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  23.15 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  21.85 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.48 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  22.7 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  22.73 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  28.75 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  25.41 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  26.53 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  21.65 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 437 aa  62.8  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0761  radical SAM family protein  28.19 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510153  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  28.68 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0795  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.33 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.48 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2461  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.89 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 574 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  31.36 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0776  Fe-S oxidoreductase-like  22.95 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 482 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0363  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  0.816586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  21.97 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.73 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.26 
 
 		 400 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  25.27 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.26 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  21.19 
 
 		 358 aa  53.5  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  21.19 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 497 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  21.89 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  21.19 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 384 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  26.18 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  21.19 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  26.18 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.86 
 
 		 372 aa  52.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  21.19 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  21.19 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  21.19 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  21.19 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  27.86 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 450 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  21.19 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  24.47 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.85 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.77 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.623593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5768  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.06 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  0.949586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.07 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  21.4 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.14 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 471 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 347 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.07 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  23.43 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.69 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  31.58 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32 
 
 		 370 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 782 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 446 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>