85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3406 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  689    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  26.22 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.77 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14401  hypothetical protein  26.74 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.32313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  22.4 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  24.74 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  22.65 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  20.82 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  21.48 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  24.48 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  23.9 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 437 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  31.82 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0795  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  31.19 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 513 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1692  radical SAM family protein  26.24 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  32.69 
 
 		 399 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  20.34 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  20 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  20.34 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  19.16 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  20.26 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 461 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  21 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 393 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.74 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.2 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  22.63 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 394 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  19.62 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  20 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  20.74 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  20 
 
 		 292 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  20 
 
 		 292 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  20 
 
 		 292 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  20 
 
 		 292 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 		 380 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  19.54 
 
 		 358 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 873 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  25.93 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1947  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.69 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.386779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.11 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  23.87 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  22.45 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  19.54 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  19.66 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0776  Fe-S oxidoreductase-like  33.75 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  35.82 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  23.93 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4751  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.08 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4250  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.98 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1235  radical SAM family protein  30.57 
 
 		 470 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 422 aa  43.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5946  molybdopterin biosynthesis, protein A  27.91 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302426  normal  0.0104705 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 394 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 397 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 395 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  22.48 
 
 		 465 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 496 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>