50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4250 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4250  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 381 aa  791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1835  hypothetical protein  42.06 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000690534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3862  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 613 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 		 843 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.78 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 465 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.95 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  22.71 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  24.16 
 
 		 301 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.65 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.06 
 
 		 327 aa  49.7  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 326 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2482  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  28.22 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 349 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0301  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis-like  29.24 
 
 		 326 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.96 
 
 		 298 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.4 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.54 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.59 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  21.53 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 342 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  22.54 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.27 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  24.12 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 286 aa  43.1  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  23.83 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>