70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0776 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0776  Fe-S oxidoreductase-like  100 
 
 
338 aa  706    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.62 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  22.15 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  25.07 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  24.75 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.13 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  22.26 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  21.97 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 
340 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 
873 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  23.53 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  26.64 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  26.64 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  26.64 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  26.64 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  26.64 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  26.64 
 
 
292 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  26.64 
 
 
292 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  24.09 
 
 
341 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.95 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  26.28 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  20.2 
 
 
342 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 
292 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  23.12 
 
 
344 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  24.25 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  20.92 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  21.84 
 
 
355 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 
384 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  20.92 
 
 
323 aa  49.7  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.46 
 
 
341 aa  49.3  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  20.08 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  26.14 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  22.02 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  20.61 
 
 
515 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 
438 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  21.93 
 
 
342 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  19.93 
 
 
307 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  20.98 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0761  radical SAM family protein  27.87 
 
 
503 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2461  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14401  hypothetical protein  32.88 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.32313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  23.32 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 
574 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2353  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  22.3 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 
459 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 
445 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  33.75 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1835  hypothetical protein  29.59 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000690534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 
317 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  23.59 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 
1005 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  21.77 
 
 
317 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0182  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.796487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 
446 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  21.1 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>