101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1835 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1835  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  711    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000690534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4250  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 
381 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3862  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 
613 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 
843 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 
438 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 
515 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.84 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 
415 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 
367 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 
326 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 
1000 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.86 
 
 
367 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 
373 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  19.51 
 
 
427 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 
329 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 
319 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  27.23 
 
 
335 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
1002 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 
326 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  23.43 
 
 
357 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.37 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 
501 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 
384 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.12 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  23.59 
 
 
354 aa  50.1  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.62 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.62 
 
 
326 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.34 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.71 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.74 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.37 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 
410 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 
371 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 
445 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 
406 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 
445 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 
406 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
345 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2394  radical SAM domain protein  25.84 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0630696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.4 
 
 
389 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.99 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 
433 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.44 
 
 
391 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  27.97 
 
 
1014 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 
409 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 
465 aa  46.2  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.37 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0776  Fe-S oxidoreductase-like  29.59 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.67 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  22.61 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.1 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1198  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00512944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.95 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 
450 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 
446 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  29.61 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.55 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.23 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 
446 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.68 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0187  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.82 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00819239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.66 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  22.17 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.94 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  21.93 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 
372 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  22.54 
 
 
368 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 
391 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
418 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 
342 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 
342 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 
414 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  23.3 
 
 
387 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 
1005 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  20.63 
 
 
429 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  21.86 
 
 
410 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 
351 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 
429 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>