More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2224 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 329 aa  690    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  46.23 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  24.75 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  25 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  29.35 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  25.69 
 
 		 342 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  22.51 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  25.25 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.77 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 421 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  21.48 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  24.7 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  26.11 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  25.32 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  26.99 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.43 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  20.54 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.43 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 450 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0776  Fe-S oxidoreductase-like  22.44 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  22.41 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2353  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  26.17 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  25.27 
 
 		 284 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.53 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  21.33 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  19.87 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  26.4 
 
 		 447 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 445 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  25.31 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.09 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.22 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.42 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  23.8 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.72 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4250  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 		 873 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1838  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  22.04 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.23 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  27.72 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  23.51 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.99 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.47 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  22.9 
 
 		 843 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14401  hypothetical protein  21.81 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.32313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  20.69 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  21.1 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  24.53 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  23 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  20.13 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  24.86 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1500  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.14 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>