More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0911 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  92.68 
 
 
287 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  92.33 
 
 
287 aa  540  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  80.14 
 
 
287 aa  473  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  59.72 
 
 
491 aa  345  7e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  28.86 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  25.81 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.22 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 
335 aa  64.3  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.12 
 
 
349 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  33.9 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 
367 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 
393 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.49 
 
 
338 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 
395 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  34.4 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 
394 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 
397 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  27.43 
 
 
413 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 
399 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  21.11 
 
 
351 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.74 
 
 
394 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.11 
 
 
335 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  28.12 
 
 
445 aa  59.3  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 
415 aa  58.9  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 
384 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 
480 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
200 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 
396 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  25.7 
 
 
491 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  31.5 
 
 
394 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  26.78 
 
 
356 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 
496 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 
391 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 
391 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.75 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 
378 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.41 
 
 
313 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 
332 aa  57  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.06 
 
 
397 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.01 
 
 
355 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 
319 aa  56.2  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 
393 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 
438 aa  55.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 
474 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 
358 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 
399 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.23 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  26.01 
 
 
462 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 
382 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.26 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  27.69 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 
343 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0458  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 
359 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  27.4 
 
 
342 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  26.27 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.98 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.42 
 
 
475 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.5 
 
 
495 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  33.93 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  34.12 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.64 
 
 
332 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 
873 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 
345 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.97 
 
 
366 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 
347 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25 
 
 
337 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.96 
 
 
479 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 
334 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  23.53 
 
 
422 aa  52.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 
372 aa  52.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.08 
 
 
348 aa  52.8  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 
497 aa  52.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 
394 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.92 
 
 
399 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  25.65 
 
 
471 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 
347 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 
501 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  23.23 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  26.14 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 
565 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.04 
 
 
491 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.04 
 
 
491 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>