44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3649 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  483  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  98.3 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  97.87 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  97.87 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  89.95 
 
 		 241 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  89.95 
 
 		 241 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  82.55 
 
 		 235 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  89.45 
 
 		 239 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  86.43 
 
 		 262 aa  401  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  76.12 
 
 		 224 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  73.87 
 
 		 200 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  74.87 
 
 		 200 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  73.98 
 
 		 202 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  65.38 
 
 		 212 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  62.38 
 
 		 210 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  42.27 
 
 		 459 aa  177  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  44.95 
 
 		 458 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  44.44 
 
 		 458 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  43.37 
 
 		 457 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  40.69 
 
 		 462 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  45.31 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.82 
 
 		 606 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.35 
 
 		 462 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  45.03 
 
 		 461 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  43.96 
 
 		 464 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  40.41 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  38.62 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  32.83 
 
 		 215 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  35.57 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  30.67 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  34.87 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  34.87 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 355 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 351 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18243  predicted protein  34.52 
 
 		 347 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 445 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  24.38 
 
 		 342 aa  42.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  25 
 
 		 338 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 372 aa  42  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 446 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>