More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1867 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  100 
 
 
459 aa  951    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  43.6 
 
 
458 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  42.73 
 
 
458 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  41.74 
 
 
462 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  42.33 
 
 
606 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  40.43 
 
 
462 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  41.83 
 
 
457 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  40.78 
 
 
464 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  40.82 
 
 
461 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  35.74 
 
 
454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  48.81 
 
 
270 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  47.64 
 
 
257 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  48.43 
 
 
254 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  47.24 
 
 
259 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  48.02 
 
 
258 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  47.08 
 
 
259 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  47.08 
 
 
259 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  47.08 
 
 
259 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  46.97 
 
 
269 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  46.97 
 
 
269 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  46.97 
 
 
269 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  46.97 
 
 
269 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  46.97 
 
 
269 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  46.97 
 
 
269 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  46.97 
 
 
269 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 
265 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 
259 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  47.47 
 
 
260 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  47.51 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  47.51 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  48.41 
 
 
273 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  47.08 
 
 
258 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  47.08 
 
 
260 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  46.97 
 
 
269 aa  233  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  45.7 
 
 
265 aa  233  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  47.08 
 
 
263 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  45.91 
 
 
259 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 
263 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  48.62 
 
 
262 aa  231  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  45.24 
 
 
262 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  47.62 
 
 
258 aa  230  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  45.63 
 
 
268 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  46.39 
 
 
263 aa  229  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  45.21 
 
 
263 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  46.74 
 
 
267 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  42.75 
 
 
256 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  45.24 
 
 
258 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  46.88 
 
 
267 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  44.44 
 
 
259 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  45.63 
 
 
271 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  43.55 
 
 
257 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  43.8 
 
 
263 aa  226  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  44.66 
 
 
257 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  44.84 
 
 
268 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  43.75 
 
 
257 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  44.84 
 
 
263 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.91 
 
 
255 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  42.91 
 
 
255 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  42.91 
 
 
255 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.91 
 
 
255 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  44.84 
 
 
265 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.91 
 
 
255 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  44.75 
 
 
258 aa  223  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  43.58 
 
 
255 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.52 
 
 
255 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  44.88 
 
 
255 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  43.08 
 
 
255 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  44.05 
 
 
263 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  44.05 
 
 
263 aa  220  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  42.91 
 
 
255 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  45.67 
 
 
259 aa  219  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  44.88 
 
 
257 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.13 
 
 
255 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  42.52 
 
 
255 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  42.64 
 
 
262 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  41.02 
 
 
255 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  42.46 
 
 
270 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  44.44 
 
 
263 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  46.88 
 
 
257 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  46.88 
 
 
257 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  41.02 
 
 
255 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  42.52 
 
 
256 aa  216  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  46.25 
 
 
260 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  45.74 
 
 
259 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  44.09 
 
 
261 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  45.24 
 
 
267 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  43.31 
 
 
264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  44.84 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  44.66 
 
 
260 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  43.7 
 
 
255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  44.49 
 
 
264 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  42.25 
 
 
262 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  43.31 
 
 
255 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  41.34 
 
 
255 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  42.97 
 
 
263 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  45.28 
 
 
266 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  46.03 
 
 
264 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  42.06 
 
 
268 aa  211  2e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  42.35 
 
 
257 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  42.35 
 
 
257 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>