44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2745 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  72.22 
 
 		 200 aa  308  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  68.69 
 
 		 224 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  65.88 
 
 		 239 aa  300  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  65.88 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  65.88 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  66.35 
 
 		 235 aa  298  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  69.19 
 
 		 200 aa  297  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  65.87 
 
 		 235 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  65.38 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  65.87 
 
 		 235 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  68.66 
 
 		 202 aa  295  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  64.93 
 
 		 262 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  67.16 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  59.13 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.78 
 
 		 459 aa  187  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  44.72 
 
 		 457 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  45.23 
 
 		 462 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  46.23 
 
 		 461 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  45.6 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  43.43 
 
 		 462 aa  158  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  42.93 
 
 		 606 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  45.3 
 
 		 464 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  41.62 
 
 		 458 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  41.12 
 
 		 458 aa  151  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  40.61 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  38.02 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  35.79 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  34.67 
 
 		 454 aa  126  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  39.05 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  35.9 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  38.1 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  37.81 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 351 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 355 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2293  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  26.95 
 
 		 336 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.388191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 565 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>