More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1695 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  100 
 
 
464 aa  960    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  61.05 
 
 
606 aa  591  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  58.64 
 
 
462 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  56.74 
 
 
462 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  55.56 
 
 
457 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  55.36 
 
 
458 aa  544  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  55.36 
 
 
458 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  55.87 
 
 
461 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  40.78 
 
 
459 aa  351  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  39.31 
 
 
454 aa  346  6e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  47.64 
 
 
255 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  47.64 
 
 
255 aa  276  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  47.64 
 
 
255 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  47.64 
 
 
255 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  47.64 
 
 
255 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  47.24 
 
 
255 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  47.64 
 
 
255 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  47.24 
 
 
255 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  47.24 
 
 
255 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  48.63 
 
 
257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  45.28 
 
 
255 aa  270  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  47.24 
 
 
255 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  47.24 
 
 
256 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  47.45 
 
 
256 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  46.85 
 
 
256 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  49.61 
 
 
256 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  48.03 
 
 
255 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  49.61 
 
 
258 aa  262  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  49.61 
 
 
256 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  46.69 
 
 
257 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  45.67 
 
 
255 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  50 
 
 
256 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  50 
 
 
253 aa  249  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  48.43 
 
 
256 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  50 
 
 
264 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  44.09 
 
 
255 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  44.31 
 
 
256 aa  242  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  43.53 
 
 
256 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  48.03 
 
 
261 aa  239  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  44.19 
 
 
264 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  42.06 
 
 
255 aa  232  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  46.03 
 
 
271 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  46.72 
 
 
261 aa  229  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  42.46 
 
 
256 aa  229  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  43.19 
 
 
257 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  43.19 
 
 
257 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  47.43 
 
 
257 aa  229  9e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  43.92 
 
 
264 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  42.91 
 
 
251 aa  225  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  45.28 
 
 
259 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  47.64 
 
 
257 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  41.41 
 
 
256 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  41.09 
 
 
262 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  47.67 
 
 
256 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  42.65 
 
 
267 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  39.68 
 
 
255 aa  219  6e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  45.31 
 
 
255 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  39.29 
 
 
256 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 
268 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.65 
 
 
254 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  45.24 
 
 
262 aa  217  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  42.13 
 
 
258 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 
273 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  41.76 
 
 
274 aa  216  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 
263 aa  216  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  42.86 
 
 
268 aa  216  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  40.94 
 
 
259 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  43.3 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  38.1 
 
 
260 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  44.71 
 
 
264 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  39.13 
 
 
278 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  42.91 
 
 
264 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  40.68 
 
 
263 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  42.25 
 
 
258 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  42.41 
 
 
258 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  43.14 
 
 
264 aa  211  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  43.25 
 
 
257 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  43.25 
 
 
257 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  43.41 
 
 
267 aa  211  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  43.25 
 
 
257 aa  211  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  42.25 
 
 
258 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  42.25 
 
 
258 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  39.84 
 
 
255 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  41.9 
 
 
270 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.84 
 
 
255 aa  209  8e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  40.23 
 
 
269 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  41.11 
 
 
270 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  40.78 
 
 
257 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  41.38 
 
 
265 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  43.48 
 
 
264 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  42.8 
 
 
257 aa  208  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  42.58 
 
 
265 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  41.22 
 
 
267 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  43.7 
 
 
262 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  41.34 
 
 
273 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  41.67 
 
 
258 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  38.55 
 
 
263 aa  207  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 
260 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  41.34 
 
 
262 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  40.55 
 
 
258 aa  206  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>