268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3389 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  60.32 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  42.29 
 
 		 200 aa  177  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  41.63 
 
 		 464 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  40.61 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  41.5 
 
 		 458 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  41 
 
 		 458 aa  141  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.81 
 
 		 457 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.8 
 
 		 462 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  36.54 
 
 		 461 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  39.7 
 
 		 454 aa  135  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  39.2 
 
 		 462 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  37 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.27 
 
 		 606 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  37.31 
 
 		 459 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  34.18 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  33.84 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 235 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  38.97 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  32.83 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  32.83 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  32.83 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  32.83 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  32.83 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47894  predicted protein  32.89 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.54 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27237  predicted protein  29.13 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29673  predicted protein  29.13 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00157248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.12 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.62 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 565 aa  58.2  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.82 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.29 
 
 		 308 aa  57  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.42 
 
 		 335 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.08 
 
 		 348 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.79 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.9 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.26 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 443 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 491 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.22 
 
 		 426 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 393 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  24.53 
 
 		 326 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 511 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  32.18 
 
 		 393 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.82 
 
 		 399 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.56 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.09 
 
 		 346 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0313  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.21 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.331207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 441 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.69 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0471  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.94 
 
 		 341 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 344 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 444 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.81 
 
 		 330 aa  52.4  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.12 
 
 		 319 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 444 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.68 
 
 		 308 aa  52  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 446 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.66 
 
 		 333 aa  51.6  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.75 
 
 		 329 aa  51.6  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.54 
 
 		 337 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 		 446 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 423 aa  51.6  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 441 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 346 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 441 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.63 
 
 		 347 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 428 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 380 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.53 
 
 		 339 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 330 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>