44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3339 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3339  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3236  radical SAM domain-containing protein  95.82 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0787  radical SAM domain-containing protein  95.82 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0944  hypothetical protein  92.02 
 
 		 262 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0884  radical SAM domain-containing protein  88.09 
 
 		 235 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3530  radical SAM domain-containing protein  85.65 
 
 		 235 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3455  Radical SAM domain protein  86.52 
 
 		 235 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3649  radical SAM domain-containing protein  89.45 
 
 		 235 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0837  radical SAM domain-containing protein  89.45 
 
 		 235 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0764  radical SAM domain-containing protein  75.88 
 
 		 200 aa  320  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.141608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0887  radical SAM domain-containing protein  69.64 
 
 		 224 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0889  radical SAM domain-containing protein  74.87 
 
 		 200 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0797  radical SAM domain-containing protein  73.98 
 
 		 202 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2745  hypothetical protein  65.88 
 
 		 212 aa  300  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0657  radical SAM domain-containing protein  64.29 
 
 		 210 aa  265  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.872238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.9 
 
 		 459 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  44.72 
 
 		 458 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  44.22 
 
 		 458 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0877  Radical SAM domain protein  44.79 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.31 
 
 		 457 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.29 
 
 		 462 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  39.7 
 
 		 462 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  43.33 
 
 		 464 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  39.29 
 
 		 606 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  42.41 
 
 		 461 aa  138  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  40.41 
 
 		 200 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0309  Radical SAM domain protein  35.79 
 
 		 197 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1747  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  31.62 
 
 		 454 aa  112  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  32.83 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  35.05 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2443  radical SAM domain-containing protein  35.15 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1325  radical SAM family protein  35.38 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1159  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2534  Radical SAM domain protein  35.2 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2630  Radical SAM domain protein  34.87 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 355 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 443 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 346 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  22.5 
 
 		 342 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 351 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 		 440 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  26.77 
 
 		 338 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>