More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1239 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  100 
 
 
454 aa  936    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40.56 
 
 
606 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  39.83 
 
 
462 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  38.18 
 
 
462 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.35 
 
 
457 aa  346  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.31 
 
 
464 aa  346  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  37.58 
 
 
458 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 
458 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  37.83 
 
 
461 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.74 
 
 
459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  50.2 
 
 
255 aa  242  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  43.58 
 
 
257 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.64 
 
 
255 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  42.53 
 
 
255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  42.91 
 
 
255 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  42.91 
 
 
255 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  42.91 
 
 
255 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.91 
 
 
255 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.91 
 
 
255 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.53 
 
 
255 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  41.18 
 
 
256 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.15 
 
 
255 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  41.38 
 
 
255 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  39.61 
 
 
256 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  42.15 
 
 
255 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  40.71 
 
 
251 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  40.31 
 
 
264 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.22 
 
 
256 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  41.09 
 
 
263 aa  196  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  41.47 
 
 
263 aa  196  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 
261 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 
256 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.4 
 
 
255 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  40.85 
 
 
262 aa  193  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.4 
 
 
255 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 
262 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  37.6 
 
 
258 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  39 
 
 
263 aa  190  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  39.53 
 
 
264 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  39.62 
 
 
262 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.96 
 
 
268 aa  190  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  39.45 
 
 
258 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  39.1 
 
 
283 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  39.1 
 
 
283 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  40.08 
 
 
264 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  39.1 
 
 
283 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  39.39 
 
 
262 aa  189  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  40.93 
 
 
262 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  39.23 
 
 
280 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  38.85 
 
 
266 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.65 
 
 
267 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  40.87 
 
 
256 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  38.85 
 
 
262 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 
253 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  42.13 
 
 
262 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  39.77 
 
 
261 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  38.85 
 
 
266 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  41.13 
 
 
261 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  39.22 
 
 
255 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  40.86 
 
 
257 aa  186  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  38.35 
 
 
274 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  38.22 
 
 
259 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  38.35 
 
 
262 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  39.11 
 
 
258 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  37.45 
 
 
258 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.97 
 
 
264 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  39.02 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  40.23 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.6 
 
 
257 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  40.23 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  37.94 
 
 
273 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  37.84 
 
 
256 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  37.84 
 
 
263 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  38.19 
 
 
256 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  40.71 
 
 
261 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  41.83 
 
 
271 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  38.93 
 
 
260 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 
260 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  38.19 
 
 
256 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  40.86 
 
 
255 aa  182  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  36.72 
 
 
255 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 
255 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
257 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  37.6 
 
 
259 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  38.76 
 
 
260 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  37.5 
 
 
255 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  37.45 
 
 
261 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  38.52 
 
 
267 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  38.91 
 
 
258 aa  180  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  37.11 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  36.68 
 
 
260 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  36.68 
 
 
260 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  37.74 
 
 
263 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 
256 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  38.61 
 
 
287 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  38.22 
 
 
258 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  38.61 
 
 
260 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  38.04 
 
 
255 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  40.62 
 
 
259 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  37.5 
 
 
255 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>