More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0168 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  59.13 
 
 
255 aa  318  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  52.17 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  51.54 
 
 
262 aa  276  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  50 
 
 
256 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  49.61 
 
 
256 aa  275  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  50.59 
 
 
255 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  49.21 
 
 
256 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  48.02 
 
 
255 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  48.02 
 
 
255 aa  261  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  48.02 
 
 
255 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  48.02 
 
 
255 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  48.02 
 
 
255 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  48.02 
 
 
255 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  47.24 
 
 
256 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  47.62 
 
 
255 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  47.62 
 
 
255 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  46.43 
 
 
255 aa  258  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  47.22 
 
 
255 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  47.22 
 
 
255 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  48.43 
 
 
253 aa  255  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  46.85 
 
 
256 aa  254  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  45.67 
 
 
464 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  43.53 
 
 
462 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  42.52 
 
 
257 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  44.66 
 
 
256 aa  241  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  43.92 
 
 
256 aa  237  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  42.75 
 
 
606 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
462 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  44.53 
 
 
257 aa  234  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  44.53 
 
 
257 aa  234  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  42.35 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  47.22 
 
 
254 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  41.34 
 
 
256 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  46.61 
 
 
251 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  41.18 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  39.92 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  39.61 
 
 
461 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  41.9 
 
 
260 aa  218  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 
458 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  40.94 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  41.96 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  38.98 
 
 
458 aa  215  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.45 
 
 
457 aa  215  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  37.85 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  36.76 
 
 
258 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  40.16 
 
 
251 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  37.05 
 
 
256 aa  208  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  40.32 
 
 
258 aa  207  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  40.68 
 
 
254 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  39.15 
 
 
263 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  40.39 
 
 
259 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  38.28 
 
 
268 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  40.39 
 
 
253 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  39.53 
 
 
253 aa  202  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.01 
 
 
264 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  38.04 
 
 
257 aa  202  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  40.39 
 
 
258 aa  201  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  40.39 
 
 
264 aa  201  9e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  36.61 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  37.69 
 
 
266 aa  198  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  36.36 
 
 
459 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  37.84 
 
 
263 aa  198  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  39 
 
 
259 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  37.01 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  39.61 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  36.02 
 
 
258 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  37.89 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  41.22 
 
 
266 aa  195  6e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 
258 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  38.34 
 
 
259 aa  195  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  38.61 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  40.39 
 
 
262 aa  194  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  37.65 
 
 
255 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  37.5 
 
 
255 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  40.94 
 
 
256 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 
255 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  39.15 
 
 
262 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  36.72 
 
 
255 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  38.28 
 
 
262 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  36.33 
 
 
263 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 
256 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 
258 aa  191  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  38.03 
 
 
261 aa  191  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  37.89 
 
 
283 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 
259 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  39.37 
 
 
263 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  37.89 
 
 
283 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  36.33 
 
 
258 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  37.89 
 
 
283 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  36.47 
 
 
258 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  38.98 
 
 
263 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  38.04 
 
 
255 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  37.89 
 
 
262 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  37.15 
 
 
257 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  37.4 
 
 
268 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  35.55 
 
 
262 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  34.13 
 
 
273 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>