More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0246 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  80.47 
 
 		 257 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  62.11 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  59.6 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  48.62 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  49.61 
 
 		 464 aa  262  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  47.45 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  46.09 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  45.45 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  42.13 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  45.06 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  45.06 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  45.06 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  45.06 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  48.85 
 
 		 462 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  45.06 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  44.66 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  45.45 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  44.27 
 
 		 255 aa  248  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  44.53 
 
 		 255 aa  248  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  44.27 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  44.66 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  45.45 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  47.69 
 
 		 606 aa  241  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  44.88 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  44.88 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  48.24 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  50.59 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  48.43 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  49.61 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  48.02 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  42.13 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  43.2 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  41.73 
 
 		 462 aa  228  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  39.53 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  44.27 
 
 		 457 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  44.71 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  41.11 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  45.02 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  39.13 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  40.71 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  42.58 
 
 		 458 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  42.58 
 
 		 458 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  41.2 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  45.56 
 
 		 461 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  40 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  39.61 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  47.64 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  39.76 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  38.25 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  39.38 
 
 		 262 aa  214  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  37.45 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  44.88 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  39.22 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  43.08 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  36.76 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  38.82 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  44.79 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  43.14 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  40 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  38.82 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  38.58 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  44.88 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  40.73 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  40.39 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  41.41 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  40.39 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  43.87 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  41.96 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  36.47 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  43.31 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  44.57 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  43.48 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  44.27 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  44.23 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  41.34 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  41.27 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  43.46 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  43.85 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  42.91 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  41.57 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  43.85 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  43.53 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  43.8 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  42.91 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  42.02 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  42.02 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  40.87 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  41.83 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  41.11 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  44.84 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  41.63 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  41.22 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  40.87 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  41.73 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  45 
 
 		 258 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>