More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4149 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  100 
 
 		 261 aa  534  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  87.69 
 
 		 261 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  87.31 
 
 		 261 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  83.78 
 
 		 260 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  83.78 
 
 		 260 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  83.78 
 
 		 260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  83.4 
 
 		 260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  81.47 
 
 		 261 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  84.17 
 
 		 287 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  84.5 
 
 		 258 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  84.11 
 
 		 260 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  59.61 
 
 		 259 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  57.25 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  56.47 
 
 		 262 aa  284  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  56.86 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  55.69 
 
 		 262 aa  279  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  56.37 
 
 		 262 aa  278  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  57.25 
 
 		 275 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  54.3 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  52.14 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  54.12 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  53.64 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  52.16 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  50.38 
 
 		 261 aa  269  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  53.73 
 
 		 283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  53.73 
 
 		 283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  53.73 
 
 		 283 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  53.33 
 
 		 262 aa  268  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  52.55 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  53.33 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  52.94 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  52.94 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  49.8 
 
 		 255 aa  264  8e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  49.8 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  51.37 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  52.55 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  50.58 
 
 		 257 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  52.45 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  52.14 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  49.41 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  53.49 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  52.08 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  52.94 
 
 		 258 aa  255  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  52.92 
 
 		 257 aa  254  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  53.73 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  51.7 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  52.94 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  53.1 
 
 		 254 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  48.63 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  51.53 
 
 		 266 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  52.69 
 
 		 265 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  53.67 
 
 		 269 aa  249  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  51.53 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  52.92 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  53.67 
 
 		 269 aa  249  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  52.27 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  53.73 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  52.27 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  52.27 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  52.27 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  49.02 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  49.41 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  51.89 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  52.73 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  48.48 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  52.73 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  51.89 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  52.73 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  52.73 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  52.73 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  52.73 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  52.73 
 
 		 265 aa  241  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  52.73 
 
 		 265 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  52.73 
 
 		 265 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 263 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  54.09 
 
 		 264 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  53.7 
 
 		 265 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  51.52 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  50.19 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  48.48 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  50.2 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  51.76 
 
 		 265 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  51.76 
 
 		 265 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  51.76 
 
 		 265 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  51.76 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  51.95 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  49.62 
 
 		 273 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  49.06 
 
 		 264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  52.94 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  52.94 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  49.06 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  49.62 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  49.81 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  49.06 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  48.69 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  45.8 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  48.12 
 
 		 269 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  48.12 
 
 		 269 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>