More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1826 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  60.78 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  61.57 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  60.39 
 
 		 260 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  60.39 
 
 		 260 aa  317  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  59.61 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  59.61 
 
 		 260 aa  314  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  60 
 
 		 260 aa  314  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  60 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  62.75 
 
 		 258 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  62.35 
 
 		 287 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  60 
 
 		 261 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  59.22 
 
 		 261 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  62.75 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  58.66 
 
 		 258 aa  307  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  54.51 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  53.73 
 
 		 255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  53.73 
 
 		 255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  57.03 
 
 		 254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  58.04 
 
 		 262 aa  298  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  55.64 
 
 		 265 aa  295  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  58.04 
 
 		 262 aa  294  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  54.85 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  54.85 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  52.92 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  57.25 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  54.83 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  55.51 
 
 		 257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  56.92 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  54.1 
 
 		 267 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  53.31 
 
 		 262 aa  288  8e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  56.86 
 
 		 283 aa  287  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  56.86 
 
 		 283 aa  287  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  52.33 
 
 		 258 aa  287  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  56.86 
 
 		 283 aa  287  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  56.86 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  56.47 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  56.69 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  55.69 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  55.69 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  55.69 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  53.99 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  52.12 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  52.51 
 
 		 263 aa  281  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  55.29 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  55.69 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  55.12 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  53.99 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  50.79 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  53.01 
 
 		 269 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  53.73 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  53.82 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  53.88 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  51.76 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  51.74 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  52.26 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  52.59 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  54.44 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  53.88 
 
 		 263 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  53.54 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  50.59 
 
 		 257 aa  271  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  53.38 
 
 		 290 aa  270  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  53.44 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  53.49 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  49.61 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  50 
 
 		 255 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  53.54 
 
 		 269 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  54.44 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  54.44 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  51.88 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  54.44 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  54.05 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  54.05 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  54.05 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  54.05 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  54.05 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  53.15 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  53.15 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  54.05 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  54.05 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  51.57 
 
 		 275 aa  265  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  53.67 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  53.28 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  52.71 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  52.71 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  52.9 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  52.76 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  52.76 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  52.9 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  49.21 
 
 		 257 aa  261  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 257 aa  261  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  49.21 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  51.55 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  53.15 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  51.76 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  53.73 
 
 		 265 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  53.73 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  53.73 
 
 		 265 aa  254  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  53.73 
 
 		 265 aa  254  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  53.73 
 
 		 265 aa  254  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>