More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1881 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  74.23 
 
 		 270 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  72.24 
 
 		 265 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  71.1 
 
 		 269 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  71.1 
 
 		 269 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  70.34 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  67.68 
 
 		 265 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  66.54 
 
 		 269 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  67.55 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  69.47 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  68.8 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  61.87 
 
 		 265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  61 
 
 		 265 aa  324  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  60 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  60 
 
 		 267 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  58.75 
 
 		 263 aa  320  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  60.75 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  61.24 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  56.03 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  58.2 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  59.77 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  59.77 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  59.77 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  58.2 
 
 		 259 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  58.2 
 
 		 260 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  58.2 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  59.53 
 
 		 258 aa  299  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  59.22 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  57.03 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  57.81 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  57.03 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  57.03 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  57.03 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  57.03 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  57.03 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  57.03 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  57.03 
 
 		 269 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  56.64 
 
 		 269 aa  291  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  55.86 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  54.3 
 
 		 263 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  55.08 
 
 		 263 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  52.71 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  47.67 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  47.67 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  48.84 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  50.77 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  50.39 
 
 		 257 aa  251  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  50.39 
 
 		 257 aa  251  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  48.45 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  50.19 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  50 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  49.42 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  47.29 
 
 		 282 aa  235  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  49.42 
 
 		 265 aa  234  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  49.42 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  49.42 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  48.06 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  49.42 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  49.42 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  49.42 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  49.42 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  49.42 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  45.56 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  49.81 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  48.65 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  48.65 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  47.49 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  48.65 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  48.45 
 
 		 265 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  48.45 
 
 		 265 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  48.45 
 
 		 265 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  48.45 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  45.17 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  48.45 
 
 		 265 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  53.67 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  46.74 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  50.19 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  49.42 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  51.74 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 261 aa  225  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  52.12 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  46.33 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  46.72 
 
 		 267 aa  221  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  45 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  49.42 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  47.67 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  41.92 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  48.46 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  47.69 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  46.33 
 
 		 275 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  44.36 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  45.45 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  44.36 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  50.58 
 
 		 287 aa  215  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  44.79 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  44.92 
 
 		 263 aa  214  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>