More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2855 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 269 aa  557  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  78.71 
 
 		 269 aa  447  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  77.95 
 
 		 269 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  79.47 
 
 		 264 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  75 
 
 		 290 aa  427  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  75.09 
 
 		 265 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  74.06 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  71.59 
 
 		 265 aa  410  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  69.78 
 
 		 265 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  69.43 
 
 		 270 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  66.54 
 
 		 258 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  59.55 
 
 		 265 aa  318  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  59.25 
 
 		 265 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  57.88 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  58.24 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  57.14 
 
 		 267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  59.85 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  56.98 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  56.6 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  58.33 
 
 		 263 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  57.58 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  58.33 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  58.33 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  58.33 
 
 		 259 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  57.2 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  57.95 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  57.95 
 
 		 269 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  57.58 
 
 		 260 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  56.6 
 
 		 254 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  58.43 
 
 		 262 aa  301  9e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  57.58 
 
 		 259 aa  301  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  57.58 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  57.2 
 
 		 269 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  57.2 
 
 		 269 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  57.2 
 
 		 269 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  57.2 
 
 		 269 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  57.2 
 
 		 269 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  57.2 
 
 		 269 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  57.2 
 
 		 269 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  55.06 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  55.3 
 
 		 257 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  52.59 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  48.87 
 
 		 255 aa  262  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  48.87 
 
 		 255 aa  261  8.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  49.44 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  49.44 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  46.64 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  49.26 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  50 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  48.15 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  46.07 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  44.81 
 
 		 258 aa  234  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  50.56 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  48.53 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  46.27 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  45.69 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1532  TatD-related deoxyribonuclease  47.62 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  47.41 
 
 		 273 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  48.89 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  45.49 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  47.19 
 
 		 263 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  49.44 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0890  TatD family Mg-dependent DNase  46.52 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.621664  normal  0.629167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  45.83 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  49.81 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  47.19 
 
 		 263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  46.67 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  47.57 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  47.19 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  47.19 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  49.44 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  46.44 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  47.19 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  47.04 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  46.39 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  49.06 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  43.7 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  45.93 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  47.01 
 
 		 262 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  47.94 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  46.07 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  44.74 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  43.98 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  44.53 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  45.49 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  45.49 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  45.35 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  45.49 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  46.04 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  44.7 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  44.32 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  43.77 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  43.94 
 
 		 264 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  45.86 
 
 		 265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  41.35 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  45.52 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>