More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1353 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  98.09 
 
 
262 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  58.37 
 
 
254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  53.76 
 
 
267 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  51.75 
 
 
261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  53.31 
 
 
259 aa  288  9e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  51.71 
 
 
263 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  50.94 
 
 
263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  52.63 
 
 
267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  52.33 
 
 
265 aa  278  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  51.75 
 
 
282 aa  277  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  53.46 
 
 
258 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  51.88 
 
 
267 aa  275  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  52.92 
 
 
257 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  50.19 
 
 
255 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  50.19 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  52.31 
 
 
265 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  53.46 
 
 
263 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  50 
 
 
258 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  53.01 
 
 
259 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  53.01 
 
 
259 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  53.01 
 
 
259 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  54.02 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  51.89 
 
 
269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  54.02 
 
 
263 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  52.09 
 
 
259 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  52.09 
 
 
260 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  51.69 
 
 
269 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  51.69 
 
 
269 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  51.69 
 
 
269 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  51.69 
 
 
269 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  51.69 
 
 
269 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  51.69 
 
 
269 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  51.69 
 
 
269 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  51.53 
 
 
259 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  51.71 
 
 
260 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  50 
 
 
258 aa  261  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  51.92 
 
 
262 aa  260  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  51.16 
 
 
263 aa  258  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  48.06 
 
 
264 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  49.43 
 
 
256 aa  255  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  50.38 
 
 
261 aa  255  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  48.83 
 
 
255 aa  254  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  47.1 
 
 
257 aa  254  9e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  49.62 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  46.9 
 
 
255 aa  251  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  49.24 
 
 
260 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  48.85 
 
 
260 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  48.44 
 
 
255 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  48.47 
 
 
260 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  48.44 
 
 
255 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  47.37 
 
 
269 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  48.45 
 
 
257 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  48.25 
 
 
275 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  48.45 
 
 
257 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  48.09 
 
 
260 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  46.9 
 
 
265 aa  245  6e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  44.75 
 
 
258 aa  245  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  47.29 
 
 
265 aa  244  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  46.99 
 
 
269 aa  244  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  49.62 
 
 
261 aa  244  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  46.69 
 
 
262 aa  244  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  46.51 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  46.51 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  46.3 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  46.51 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  46.51 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  46.69 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  46.51 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  46.51 
 
 
265 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  46.51 
 
 
265 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  46.51 
 
 
265 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  49.62 
 
 
258 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  46.3 
 
 
262 aa  241  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  48.85 
 
 
261 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  46.92 
 
 
258 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  48.48 
 
 
261 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  45.17 
 
 
257 aa  238  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  45.95 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  47.01 
 
 
290 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  45.14 
 
 
262 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  46.72 
 
 
265 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  46.72 
 
 
265 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  46.72 
 
 
265 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  48.85 
 
 
260 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  48.46 
 
 
287 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  46.07 
 
 
269 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  47.1 
 
 
269 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  47.1 
 
 
269 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  47.1 
 
 
269 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  47.35 
 
 
265 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  46.72 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  46.24 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  47.53 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  46.72 
 
 
265 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  44.4 
 
 
269 aa  234  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  44.14 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  43.58 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  45.56 
 
 
258 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  46.44 
 
 
265 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>