More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1106 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  55.08 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  53.1 
 
 		 265 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  52.67 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  53.94 
 
 		 254 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  52.67 
 
 		 267 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  55.69 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  51.91 
 
 		 267 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  49.03 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  49.42 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  52.76 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  50.97 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  53.67 
 
 		 258 aa  258  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  51.76 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  52.33 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  51.97 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  48.45 
 
 		 262 aa  251  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  51.75 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  50.39 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  47.92 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  48.45 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  50 
 
 		 263 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  50.97 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  50.97 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  50.97 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  49.43 
 
 		 269 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  50.97 
 
 		 259 aa  244  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  50.97 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  49.07 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  56.25 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  49.43 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  51.36 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  49.44 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  50.97 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  50 
 
 		 270 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  46.48 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  49.42 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  46.06 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  48.05 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  49.42 
 
 		 263 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  46.85 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  52.55 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  48.48 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  52.55 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  55.47 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  50 
 
 		 268 aa  235  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  44.62 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  55.08 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  52.16 
 
 		 260 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  47.69 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  52.55 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  51.76 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  52.94 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  47.86 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  43.7 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  43.7 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  47.64 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  48.28 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  47.64 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  47.64 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  45.45 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  45.53 
 
 		 258 aa  228  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  47.88 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  47.47 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  47.04 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  48.45 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  46.85 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  45.53 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  50.98 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  49.22 
 
 		 265 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  52.73 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  48.83 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  48.26 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  47.86 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  47.86 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  47.86 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  47.86 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  49.04 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  47.86 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  45.85 
 
 		 271 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  47.86 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  47.86 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  47.86 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  47.86 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  47.88 
 
 		 283 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  47.88 
 
 		 283 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  47.88 
 
 		 283 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  48.44 
 
 		 262 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  49.04 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>