More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1533 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  72.09 
 
 		 267 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  63.26 
 
 		 268 aa  351  8e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  62.93 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  60.46 
 
 		 263 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  60.46 
 
 		 265 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  60.08 
 
 		 263 aa  329  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  59.92 
 
 		 262 aa  327  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  61.96 
 
 		 273 aa  325  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  64.34 
 
 		 264 aa  322  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  60.84 
 
 		 263 aa  322  5e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  61.63 
 
 		 260 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  61.63 
 
 		 260 aa  321  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  60 
 
 		 270 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  59.53 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  59.14 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  58.04 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  59.53 
 
 		 264 aa  311  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  54.48 
 
 		 270 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  58.94 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  56.25 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  53.52 
 
 		 257 aa  295  8e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  57.79 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  55.86 
 
 		 265 aa  293  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  55.86 
 
 		 265 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  56.08 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  55.08 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  53.28 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  53.94 
 
 		 265 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  49.42 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  53.31 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  59.65 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  55.91 
 
 		 269 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  51.91 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  54.33 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  49.02 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  50.59 
 
 		 259 aa  265  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  54.47 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  49.41 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  53.46 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  47.08 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  46.46 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  47.1 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  45.1 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  43.75 
 
 		 268 aa  238  8e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 255 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  45.67 
 
 		 257 aa  232  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  44.57 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  43.24 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  42.13 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  45.52 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  46.01 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  41.92 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  43.08 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  45.63 
 
 		 459 aa  226  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  43.97 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  44.78 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  45.8 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.82 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  44.36 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  45.25 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  45.85 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  45.85 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  44.23 
 
 		 258 aa  221  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  43.98 
 
 		 260 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  41.11 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.11 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  40.71 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  42.69 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  40.71 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.55 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  40.71 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  40.71 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.71 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.71 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  43.61 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  40.71 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  43.73 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  45.7 
 
 		 261 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  42.8 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  44.53 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  43.24 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  45.7 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  41 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  45.59 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  39.13 
 
 		 255 aa  215  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  43.36 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  47.06 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  40.39 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  43.56 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  41.34 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  45.49 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  39.3 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  39.46 
 
 		 263 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  41.09 
 
 		 261 aa  212  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  41.96 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  42.19 
 
 		 255 aa  211  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  41.96 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  39.06 
 
 		 255 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>