More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0920 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  75.77 
 
 		 265 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  76.34 
 
 		 265 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  76.92 
 
 		 265 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  70.23 
 
 		 267 aa  378  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  72.41 
 
 		 265 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  71.48 
 
 		 267 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  58.66 
 
 		 270 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  57.87 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  55.91 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  56.92 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  55.77 
 
 		 265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  56.3 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  55.38 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  53.41 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  55 
 
 		 265 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  53.99 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  53.94 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  58.66 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  53.54 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  53.54 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  53.94 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  53.61 
 
 		 266 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  52.36 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  52.36 
 
 		 263 aa  265  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  51.97 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  51.56 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  54.33 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  51.18 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  52.65 
 
 		 263 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  51.37 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  46.46 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  50.59 
 
 		 260 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  49.42 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  51.75 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  48.44 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  45.1 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  50.38 
 
 		 263 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  46.67 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  45.7 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  47.47 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  41.02 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  41.31 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  44.92 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  46.47 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  46.47 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  46.47 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  45.95 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  46.47 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  46.47 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  46.47 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  46.47 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  47.08 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  47.1 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  45.88 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  48.63 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  44.49 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  46.56 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  49.81 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  49.81 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  44.4 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  45.69 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  44.74 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  43.68 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  44.36 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.67 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  48.66 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  45.45 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  44.98 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  45.14 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  44.7 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  45.1 
 
 		 261 aa  208  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  44.32 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  45.59 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  45.59 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  45.59 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  43.18 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  45.1 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  44.23 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  43.18 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  43.19 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  45.21 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  44.71 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  45.88 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  44.71 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  44.4 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  42.38 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  45.1 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  41.7 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  44.23 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  44.06 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  42.01 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  44.44 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  44.83 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  45.1 
 
 		 258 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  42.41 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  40.47 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>