More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4557 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 265 aa  527  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  99.25 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  96.6 
 
 		 265 aa  510  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  79.23 
 
 		 266 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  69.14 
 
 		 268 aa  348  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  69.14 
 
 		 270 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  61.24 
 
 		 267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  55.86 
 
 		 271 aa  293  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  54.3 
 
 		 263 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  53.67 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  59.77 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  56.76 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  54.02 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  54.69 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  55.3 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  55.25 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  53.03 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  53.12 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  54.69 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  54.69 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  51.56 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  52.73 
 
 		 268 aa  272  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  57.03 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  55.21 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  55.6 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  55.6 
 
 		 265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  53.52 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  53.91 
 
 		 264 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  55.38 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  52.14 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  52.11 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  55 
 
 		 265 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  52.51 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  50.39 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  52.67 
 
 		 263 aa  245  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  48.65 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  45.91 
 
 		 258 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  45.74 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  44.79 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  46.9 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  42.53 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  41.86 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  52 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  45.31 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  43.87 
 
 		 459 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  41.63 
 
 		 255 aa  206  5e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  42.47 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.02 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  45.38 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  45.38 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  43.8 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  42.11 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  38.82 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  47.35 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  45 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  44.62 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  45.59 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  43.85 
 
 		 261 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  42.52 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  38.85 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  40.44 
 
 		 269 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  44.83 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  40.98 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  44.4 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  44.4 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  42.8 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  38.85 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  42.8 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  42.11 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 260 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  43.41 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  41.57 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  40.39 
 
 		 464 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  41.31 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  39.62 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  42.41 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  39.85 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  41.63 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  41.63 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  44.53 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  39.85 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  40.44 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  42.05 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  37.64 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.82 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  43.53 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.82 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  40 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  38.49 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  42.02 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  40.07 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  40.53 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  40.61 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  43.1 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  41 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.45 
 
 		 462 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  39.1 
 
 		 262 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>