More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3593 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  70.88 
 
 		 267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  75.38 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  75.19 
 
 		 265 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  75.77 
 
 		 265 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  70.04 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  70.23 
 
 		 269 aa  348  5e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  53.03 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  53.41 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  54.44 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  53.03 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  53.54 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  52.94 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  52.36 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  53.54 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  51.91 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  50.98 
 
 		 268 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  51.14 
 
 		 265 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  51.18 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  51.57 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 263 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  52.31 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  54.33 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  51.37 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  47.71 
 
 		 263 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  49.61 
 
 		 264 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  47.91 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  50.2 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  51.55 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  50.39 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  49.02 
 
 		 263 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  44.88 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  53.12 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  45.1 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  45.49 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  43.41 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  43.92 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  46.39 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  45.85 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  42.91 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  42.25 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  46.3 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  44.71 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  44.31 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  44.71 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  44.27 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  47.33 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  43.92 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  44.31 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  43.48 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  44.32 
 
 		 269 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  44.87 
 
 		 290 aa  215  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  43.51 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  43.51 
 
 		 267 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  44.57 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  42.8 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  43.94 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  44.49 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  42.25 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  44.31 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  44.71 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  43.3 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  43.77 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  42.58 
 
 		 265 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  45.59 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  43.92 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  42.86 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  42.08 
 
 		 261 aa  206  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  43.18 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  43.53 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  39.45 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  41.15 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  41.02 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  43.97 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  41.92 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  41.96 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  42.35 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  43.68 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.75 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  43.8 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  42.91 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  43.53 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  40.23 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  43.8 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.61 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  40.6 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  42.75 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  42.46 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  41.8 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  41.27 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  40.6 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  39.61 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  44.92 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  41.8 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  42.58 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>