More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0555 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  100 
 
 		 265 aa  534  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  94.72 
 
 		 265 aa  507  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  94.72 
 
 		 265 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  76.6 
 
 		 265 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  75.77 
 
 		 267 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  72.48 
 
 		 267 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  76.92 
 
 		 269 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  56.86 
 
 		 268 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  56.86 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  54.65 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  57.03 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  56.92 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  54.33 
 
 		 271 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  53.94 
 
 		 263 aa  275  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  53.94 
 
 		 263 aa  276  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  56.69 
 
 		 270 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  53.54 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  53.31 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  55.38 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  55.77 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  53.15 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  57.87 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  55 
 
 		 265 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  53.33 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  52.14 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  51.95 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  50.39 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  51.57 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  50.79 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  51.76 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  52.33 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  51.57 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  44.49 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  50.39 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  49.41 
 
 		 263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  46.85 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  50.19 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  47.27 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  45.53 
 
 		 258 aa  224  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  45.7 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  45.88 
 
 		 258 aa  222  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  50.45 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  45.91 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  45.74 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  46.27 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  45.74 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  43.31 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  48.28 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  48.28 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  45.83 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  42.64 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  42.58 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  40.08 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  45.1 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  45.42 
 
 		 270 aa  211  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  40.23 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  45.56 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  44.23 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  42.25 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  45.83 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  44.61 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  44.61 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  45.08 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  41.41 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  44.66 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  47.06 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  42.19 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  43.92 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  44.32 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  43.58 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  41.09 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  41.41 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  40.7 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.75 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  41.41 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  42.64 
 
 		 464 aa  205  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  43.02 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  43.58 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  43.19 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  46.15 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  46.36 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  46.36 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  46.36 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  44.31 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  46.36 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  46.36 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  46.36 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  46.36 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  42.42 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  43.19 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  45.17 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  45.77 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  45.77 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  45.77 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  44.31 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  43.56 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  45.1 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>