More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1515 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  79.92 
 
 		 265 aa  411  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  79.92 
 
 		 265 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  79.23 
 
 		 265 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  71.6 
 
 		 268 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  71.6 
 
 		 270 aa  367  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  61 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  57.98 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  55.25 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  55.47 
 
 		 270 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  54.47 
 
 		 265 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  54.86 
 
 		 263 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  59.92 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  56.59 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  53.28 
 
 		 271 aa  279  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  53.7 
 
 		 260 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  52.14 
 
 		 257 aa  278  9e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  54.09 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  55.81 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  53.31 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  54.09 
 
 		 263 aa  275  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  55.25 
 
 		 264 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  52.92 
 
 		 268 aa  274  9e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  56.15 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  52.53 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  56.15 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  54.44 
 
 		 265 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  54.47 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  55.77 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  52.31 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  53.28 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  51.75 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  52.14 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  53.61 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  48.26 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  47.69 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  46.9 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  52.09 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  47.51 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  41.7 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  46.3 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  41.76 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  51.56 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  45.95 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  47.29 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  41.7 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.63 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  45.28 
 
 		 459 aa  212  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  44.57 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  41.6 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  39.85 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  39.85 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  43.45 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  40.94 
 
 		 464 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  38.76 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  45.25 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  45.25 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  42.32 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  43.51 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  43.07 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  41.67 
 
 		 265 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  43.07 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  41.73 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  40.53 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  41.54 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  42.32 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  43.07 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  42.7 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  42.7 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  42.7 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  39.56 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.33 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  45.74 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  40.61 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  41.95 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  41.95 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  40.61 
 
 		 265 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  42.64 
 
 		 270 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  45.35 
 
 		 258 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  40 
 
 		 606 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  44.96 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  41.89 
 
 		 264 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  41.57 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  42.16 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  42.41 
 
 		 256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  43.46 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  41.22 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  40.7 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  41.09 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  38.78 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  40 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.43 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  41.44 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  44.75 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  40.45 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  43.08 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>