More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1938 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 259 aa  530  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  64.98 
 
 		 258 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  62.65 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  54.51 
 
 		 268 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  50.59 
 
 		 271 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  49.8 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  50.78 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  52.16 
 
 		 267 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  47.86 
 
 		 270 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  47.06 
 
 		 262 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  47.84 
 
 		 263 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  46.67 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  46.9 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  47.45 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  47.84 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  46.27 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  48.24 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  45.88 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  46.27 
 
 		 263 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  49.8 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  45.7 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  47.45 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  46.9 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  47.24 
 
 		 459 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  49.03 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  47.51 
 
 		 266 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  46.12 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  46.27 
 
 		 263 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  45.74 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  47.08 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  47.1 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  41.96 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  47.76 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  47.39 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  43.92 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  46.44 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  43.75 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  41.41 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  44.23 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  46.21 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  46.21 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  46.21 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  44.75 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 269 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 269 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 269 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  45.98 
 
 		 269 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 269 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 269 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 269 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  45.59 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  43.8 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  45.59 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  44.36 
 
 		 263 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  45.59 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  45.21 
 
 		 263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  44.62 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  45.63 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  45.95 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  43.18 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  43.46 
 
 		 262 aa  214  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  46.48 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  42.97 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  44.36 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  45.17 
 
 		 263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  44.36 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  44.36 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  43.58 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  45.63 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  42.69 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  45.42 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  43.97 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  44.92 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  44.19 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  42.47 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  42.25 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  42.47 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  42.05 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  43.3 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  42.41 
 
 		 263 aa  208  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.15 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  43.56 
 
 		 269 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  43.77 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  45.38 
 
 		 261 aa  208  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  39.77 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  44.92 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  43.35 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  42.15 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  42.8 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  41.67 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  43.41 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>