More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2718 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  89.27 
 
 		 262 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  88.59 
 
 		 265 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  79.09 
 
 		 263 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  79.09 
 
 		 263 aa  431  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  80.99 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  79.85 
 
 		 263 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  63.53 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  60.46 
 
 		 271 aa  332  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  60.38 
 
 		 267 aa  332  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  60.7 
 
 		 259 aa  329  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  60.08 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  60.08 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  57.36 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  60.47 
 
 		 264 aa  314  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  59.22 
 
 		 268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  54.75 
 
 		 270 aa  310  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  57.53 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  57.92 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  58.08 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  57.25 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  53.12 
 
 		 257 aa  298  8e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  54.69 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  54.69 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  54.3 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  54.86 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  59.73 
 
 		 228 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  53.73 
 
 		 265 aa  271  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  51.18 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  49.42 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  50.79 
 
 		 265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  50.39 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  50.79 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  47.84 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  49.03 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  53.54 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  46.27 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  50.79 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  48.22 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  44.71 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  47.27 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  45.1 
 
 		 260 aa  239  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  44.31 
 
 		 258 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  46.33 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  45.56 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  46.25 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  47.67 
 
 		 258 aa  238  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  41.92 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  46.07 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  43.08 
 
 		 265 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  50.19 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  44.14 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  43.24 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  47.19 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  45.52 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.84 
 
 		 459 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  45.52 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  42.64 
 
 		 258 aa  222  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  41.86 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  41.86 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  46.74 
 
 		 258 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  46.74 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.69 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  46.88 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  48.05 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  48.05 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  44.49 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  43.02 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  45.53 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  45.53 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  45.53 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  46.36 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  44.75 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  40.32 
 
 		 257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  44.36 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  46.88 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  48.46 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  43.56 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  42.08 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  42.97 
 
 		 263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  46.88 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  45.21 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  41.41 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  40.46 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  40.91 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  43.58 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  43.41 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  45.31 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  40.39 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  43.97 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  43.92 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  44.36 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  43.08 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  40.93 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  42.15 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  43.36 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  43.58 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>