More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6920 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 268 aa  530  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  86.67 
 
 		 270 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  71.81 
 
 		 266 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  70.93 
 
 		 265 aa  360  9e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  69.77 
 
 		 265 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  69.38 
 
 		 265 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  61.18 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  61.33 
 
 		 273 aa  316  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  58.04 
 
 		 271 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  59.22 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  59.22 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  58.82 
 
 		 263 aa  311  9e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  58.4 
 
 		 265 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  59.54 
 
 		 263 aa  309  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  58.43 
 
 		 262 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  61.18 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  57.25 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  57.25 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  60.78 
 
 		 263 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  54.85 
 
 		 270 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  57.81 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  56.47 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  55.86 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  53.33 
 
 		 268 aa  285  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  57.75 
 
 		 265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  56.47 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  54.3 
 
 		 260 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  57.03 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  52.33 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  50.59 
 
 		 257 aa  279  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  53.1 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  55.81 
 
 		 257 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  57.42 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  51.72 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  55.94 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  55.17 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  47.1 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  47.47 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  47.84 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  44.14 
 
 		 255 aa  235  7e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  47.49 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  52.68 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  45.95 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  40.47 
 
 		 260 aa  224  9e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.84 
 
 		 459 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  45.7 
 
 		 259 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  45.11 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.58 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  42.7 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  43.19 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  43.08 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  46.69 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  46.69 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  44.23 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  41.02 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  42.47 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  47.88 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  42.86 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  42.64 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  42.86 
 
 		 267 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  43.68 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  43.68 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  43.68 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  43.3 
 
 		 259 aa  208  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  44.75 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  43.51 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  41.95 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  41.95 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  41.95 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  41.95 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  41.95 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  42.25 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  41.95 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  41.95 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  42.53 
 
 		 260 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  42.53 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  45.74 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  46.12 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  44.96 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  45.63 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  45.63 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  39.25 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  46.48 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  43.02 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  43.02 
 
 		 260 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  38.87 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  37.94 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  44.57 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  41.22 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  41.34 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  43.8 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  39.1 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  41.6 
 
 		 265 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  44.57 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  41.89 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.13 
 
 		 464 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  42.64 
 
 		 260 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>