More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1989 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  91.15 
 
 		 260 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  77.31 
 
 		 259 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  78.95 
 
 		 228 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  71.04 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  69.11 
 
 		 263 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  68.73 
 
 		 263 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  70.66 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  61.87 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  62.89 
 
 		 273 aa  330  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  62.4 
 
 		 262 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  62.02 
 
 		 263 aa  322  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  61.63 
 
 		 271 aa  321  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  61.15 
 
 		 263 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  60.08 
 
 		 263 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  58.53 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  57.36 
 
 		 268 aa  306  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  57.36 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  59.69 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  56.64 
 
 		 270 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  58.69 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  55.47 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  54.3 
 
 		 268 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  53.31 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  51.35 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  52.73 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  53.33 
 
 		 265 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  52.11 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  52.94 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  52.11 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  51.34 
 
 		 265 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  50.98 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  46.33 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  50.2 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  51.34 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  51.76 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  51.37 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  44.14 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  44.53 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  42.08 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  45.91 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  41.54 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  42.97 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  45.98 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  45.77 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  46.15 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  42.97 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  46.25 
 
 		 459 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  43.24 
 
 		 268 aa  215  7e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  44.31 
 
 		 462 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  43.01 
 
 		 267 aa  211  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  42.69 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  44.02 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  42.08 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.58 
 
 		 462 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  42.65 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  42.91 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  41.54 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  44.19 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  41.96 
 
 		 606 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.76 
 
 		 464 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.93 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  44.88 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  44.88 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.77 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  41.91 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.94 
 
 		 457 aa  205  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  43.7 
 
 		 458 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  42.41 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  45.7 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  42.21 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.41 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  43.31 
 
 		 458 aa  201  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.41 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  42.41 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  42.41 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  41.63 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  43.24 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.41 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  45.28 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  43.97 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  42.41 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  42.15 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  42.02 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  41.06 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.02 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  40.78 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  43.97 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  42.86 
 
 		 263 aa  198  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  44.36 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.02 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  39.61 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  41.76 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  44.53 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  42.64 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  41.76 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  41.44 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>