More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2146 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  100 
 
 		 265 aa  534  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  76.6 
 
 		 265 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  76.23 
 
 		 265 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  76.6 
 
 		 265 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  69.65 
 
 		 267 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  70.04 
 
 		 267 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  72.41 
 
 		 269 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  57.65 
 
 		 268 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  58.04 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  56.08 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  53.73 
 
 		 259 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  54.65 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  55.86 
 
 		 273 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  54.3 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  55.6 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  58.43 
 
 		 264 aa  274  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  55.6 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  54.69 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  54.9 
 
 		 263 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  55.21 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  52.94 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  53.73 
 
 		 263 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  52.16 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  53.33 
 
 		 263 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  53.52 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  53.33 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  52.16 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  54.44 
 
 		 266 aa  268  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  52.73 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  53.7 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  49.61 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  54.12 
 
 		 263 aa  248  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  52.16 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  46.67 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  47.84 
 
 		 264 aa  235  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  47.27 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  48.64 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  48.28 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  48.28 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  48.83 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  44.31 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  47.13 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  48.66 
 
 		 263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  47.08 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  45.56 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  48.05 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  41.8 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  49.55 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  44.83 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  41.92 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  46.24 
 
 		 267 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  43.24 
 
 		 261 aa  214  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  44.53 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  42.81 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  46.09 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.97 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  41.09 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  45.42 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  43.77 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  41.25 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  43.75 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  45.31 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  44.92 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  41.38 
 
 		 464 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  44.92 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  41.95 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  42.08 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  46.48 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  44.14 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  39.92 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  41.92 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  41.89 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  44.27 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  44.27 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  44.27 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  44.27 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  44.27 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  44.27 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  44.27 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  44.92 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  40.78 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  43.18 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  42.29 
 
 		 459 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  46.09 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  44.14 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  41.51 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  43.24 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  41.73 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  42.48 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  44.11 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.86 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  44.06 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  41.09 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  41.09 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  42.08 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  39.38 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  42.47 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.86 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>