More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1540 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 262 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  68.5 
 
 		 265 aa  377  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  68.9 
 
 		 254 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  67.58 
 
 		 265 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  69.14 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  67.18 
 
 		 267 aa  362  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  68.99 
 
 		 258 aa  360  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  65.27 
 
 		 267 aa  357  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  64.5 
 
 		 267 aa  351  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  64.48 
 
 		 269 aa  345  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  63.04 
 
 		 257 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  64.48 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  64.48 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  64.48 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  63.98 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  62.45 
 
 		 263 aa  342  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  64.09 
 
 		 259 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  63.71 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  63.71 
 
 		 259 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  63.32 
 
 		 260 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  63.71 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  63.71 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  63.71 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  63.71 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  63.71 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  61.92 
 
 		 263 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  63.71 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  63.71 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  60.54 
 
 		 263 aa  334  7.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  62.31 
 
 		 263 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  62.74 
 
 		 290 aa  328  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  61.98 
 
 		 264 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  59.25 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  59.25 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  60.54 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  60.46 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  60 
 
 		 265 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  58.43 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  59.85 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  59.22 
 
 		 258 aa  311  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  57.25 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  54.09 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  53.88 
 
 		 259 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  54.12 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  54.12 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  51.92 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  51.53 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  51.54 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  51.76 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  52.94 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  50.39 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  49.8 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  49.8 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  49.42 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  51.35 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  48.06 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  47.15 
 
 		 268 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  48.24 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  50.2 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  50.57 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  51.72 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  49.81 
 
 		 260 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  49.8 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  48.82 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  48.66 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  45.74 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  49.42 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  48.62 
 
 		 459 aa  239  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  47.45 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  48.82 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  49.02 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  48.82 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  48.82 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  47.04 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  50.19 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  50.19 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  48.66 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  47.66 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  47.64 
 
 		 264 aa  235  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  46.67 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  46.12 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  50.98 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  48.03 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  48.45 
 
 		 273 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  46.51 
 
 		 263 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 		 261 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  47.83 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  46.51 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  46.15 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  47.43 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  47.43 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  47.43 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  47.43 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  47.43 
 
 		 255 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  46.85 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  47.43 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  47.43 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  45.24 
 
 		 464 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  47.13 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  44.96 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>