More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1008 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  80.99 
 
 		 269 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  80.99 
 
 		 269 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  81.37 
 
 		 264 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  73.11 
 
 		 290 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  71.59 
 
 		 269 aa  410  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  70.08 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  69.32 
 
 		 265 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  67.55 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  68.54 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  64.02 
 
 		 265 aa  359  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  60.46 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  56.27 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  56.67 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  55.93 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  55.47 
 
 		 265 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  55.3 
 
 		 259 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  55.3 
 
 		 259 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  55.3 
 
 		 259 aa  297  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  55.19 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  55.3 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  55.3 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  54.72 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  56.82 
 
 		 258 aa  296  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  53.21 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  54.17 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  54.55 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  53.79 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  53.79 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  53.79 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  53.79 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  53.79 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  53.79 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  53.79 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  53.41 
 
 		 269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  55.3 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  51.52 
 
 		 254 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  52.27 
 
 		 257 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  53.03 
 
 		 263 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  51.89 
 
 		 263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  50 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  47.74 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  45.66 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  45.86 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  48.48 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  48.48 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  45.86 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  48.12 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  46.44 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  45.69 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  46.44 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  44.94 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  46.24 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  46.82 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  46.82 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  46.82 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  44.4 
 
 		 258 aa  225  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  43.07 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  44.36 
 
 		 263 aa  221  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  46.07 
 
 		 265 aa  221  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  44.57 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  44.53 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  45.11 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  46.04 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  46.62 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  45.86 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  46.82 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  41.2 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  45.49 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  44.19 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  46.07 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  46.07 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  46.07 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  47.94 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  44.85 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  47.19 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.82 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  43.94 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  44.24 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  45.35 
 
 		 275 aa  211  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  44.07 
 
 		 262 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  43.28 
 
 		 262 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  43.12 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  44.94 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1532  TatD-related deoxyribonuclease  42.65 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  44.94 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  45.45 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  45.08 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  42.38 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  43.7 
 
 		 283 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  43.7 
 
 		 283 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  44.07 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  42.38 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>