More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2501 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  99.62 
 
 
265 aa  541  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  99.62 
 
 
265 aa  541  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  99.62 
 
 
265 aa  541  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  99.25 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  99.25 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  93.21 
 
 
265 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  93.58 
 
 
265 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  93.58 
 
 
265 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  93.21 
 
 
265 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  93.21 
 
 
265 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  90.11 
 
 
264 aa  493  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  77.78 
 
 
264 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  76.25 
 
 
265 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  76.05 
 
 
269 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  76.05 
 
 
269 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  76.05 
 
 
269 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  76.26 
 
 
258 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  73.76 
 
 
264 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  73.76 
 
 
265 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  59.85 
 
 
266 aa  333  2e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  59.61 
 
 
257 aa  315  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  55.73 
 
 
258 aa  291  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  55.34 
 
 
255 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  54.15 
 
 
256 aa  288  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  54.94 
 
 
255 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  54.09 
 
 
255 aa  285  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  54.44 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  55.21 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  55.21 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  55 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  55.21 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  54.55 
 
 
255 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  55.21 
 
 
266 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  55.21 
 
 
266 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  55 
 
 
262 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  53.85 
 
 
262 aa  279  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  54.44 
 
 
262 aa  278  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  54.44 
 
 
274 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  51.37 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  53.67 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  54.05 
 
 
280 aa  272  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  54.23 
 
 
262 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  52.69 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  51.72 
 
 
263 aa  268  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  53.36 
 
 
262 aa  267  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  54.51 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  53.73 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  54.12 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  54.12 
 
 
260 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  53.33 
 
 
260 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  50 
 
 
258 aa  248  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  53.91 
 
 
261 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  46.51 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  54.9 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  55.47 
 
 
258 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  51.57 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  52.73 
 
 
261 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  50.39 
 
 
258 aa  241  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  55.08 
 
 
260 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  52.34 
 
 
261 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  45.74 
 
 
262 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  51.56 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  49.21 
 
 
261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  49.42 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  50.98 
 
 
282 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  46.77 
 
 
265 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  45.86 
 
 
263 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  48.62 
 
 
258 aa  227  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  46.12 
 
 
266 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  47.45 
 
 
257 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  46.92 
 
 
262 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  44.09 
 
 
255 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  44.09 
 
 
255 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  47.86 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  47.86 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  44.74 
 
 
267 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  46.01 
 
 
265 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  49.62 
 
 
270 aa  222  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  47.19 
 
 
269 aa  221  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  45.49 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  46.82 
 
 
269 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  45.45 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  44.98 
 
 
269 aa  218  8.999999999999998e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  43.98 
 
 
267 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  46.07 
 
 
290 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  43.3 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  45.98 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  46.64 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  45.86 
 
 
269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  47.01 
 
 
263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0890  TatD family Mg-dependent DNase  42.15 
 
 
269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.621664  normal  0.629167 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1532  TatD-related deoxyribonuclease  42.53 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380939  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  44.94 
 
 
265 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  47.35 
 
 
259 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  47.35 
 
 
259 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>