More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3409 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  100 
 
 
264 aa  547  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  84.85 
 
 
269 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  84.85 
 
 
269 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  82.89 
 
 
290 aa  457  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  81.37 
 
 
265 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  79.47 
 
 
269 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  77.19 
 
 
264 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  75.76 
 
 
265 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  69.81 
 
 
265 aa  384  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  72.83 
 
 
270 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  70.34 
 
 
258 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  60.37 
 
 
267 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  59.26 
 
 
267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  59.26 
 
 
267 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  60.31 
 
 
265 aa  318  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  59.09 
 
 
265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  61.98 
 
 
262 aa  311  9e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  58.17 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  58.17 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  58.17 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  56.44 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  57.79 
 
 
260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  57.79 
 
 
260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  57.41 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  57.03 
 
 
258 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  55.89 
 
 
254 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  57.41 
 
 
269 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  57.41 
 
 
269 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  57.41 
 
 
269 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  57.41 
 
 
269 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  57.41 
 
 
269 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  57.41 
 
 
269 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  58.17 
 
 
269 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  57.41 
 
 
269 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  57.41 
 
 
259 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  54.55 
 
 
263 aa  298  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  54.75 
 
 
257 aa  290  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  56.27 
 
 
263 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  57.41 
 
 
258 aa  287  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  54.75 
 
 
263 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  53.61 
 
 
263 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  51.88 
 
 
259 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  49.62 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  49.43 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  45.86 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  49.43 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  45.86 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  46.97 
 
 
257 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  46.99 
 
 
255 aa  238  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  46.24 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  45.86 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  49.06 
 
 
261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  49.44 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  49.06 
 
 
260 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  48.87 
 
 
282 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  49.06 
 
 
260 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  47.06 
 
 
262 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  48.69 
 
 
260 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  49.44 
 
 
261 aa  228  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  47.37 
 
 
264 aa  228  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  44.74 
 
 
258 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1532  TatD-related deoxyribonuclease  44.85 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380939  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  46.82 
 
 
258 aa  225  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  50.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  49.06 
 
 
261 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0890  TatD family Mg-dependent DNase  44.85 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.621664  normal  0.629167 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  45.52 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  47.57 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  45.69 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  48.69 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  45.69 
 
 
269 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  45.69 
 
 
269 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  44.91 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  43.77 
 
 
268 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  46.27 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  47.94 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  45.83 
 
 
258 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  44.87 
 
 
257 aa  215  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  42.91 
 
 
255 aa  214  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  45.28 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  44.57 
 
 
265 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  42.54 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  44.78 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  40.38 
 
 
266 aa  211  7.999999999999999e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  43.77 
 
 
267 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  43.98 
 
 
264 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  44.94 
 
 
265 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  42.86 
 
 
263 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  44.91 
 
 
273 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  43.23 
 
 
257 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  43.77 
 
 
270 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  46.04 
 
 
258 aa  208  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  44.94 
 
 
265 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 
265 aa  208  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 
265 aa  208  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  44.94 
 
 
265 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 
265 aa  208  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 
265 aa  208  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 
265 aa  208  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  44.94 
 
 
265 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>