More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1942 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  95.8 
 
 		 263 aa  520  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  90.08 
 
 		 263 aa  495  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  87.16 
 
 		 269 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  87.94 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  87.94 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  87.94 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  87.94 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  87.94 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  87.94 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  87.94 
 
 		 269 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  88.33 
 
 		 259 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  88.33 
 
 		 259 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  88.33 
 
 		 259 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  87.55 
 
 		 259 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  86.77 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  86.38 
 
 		 259 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  86.77 
 
 		 260 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  69.8 
 
 		 265 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  69.26 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  65.78 
 
 		 267 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  65.02 
 
 		 267 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  64.26 
 
 		 267 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  63.28 
 
 		 254 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  63.98 
 
 		 262 aa  334  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  61.24 
 
 		 263 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  61.24 
 
 		 263 aa  332  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  61.72 
 
 		 258 aa  325  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  59.62 
 
 		 265 aa  315  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  60.98 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  59.77 
 
 		 257 aa  313  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  60.23 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  58.33 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  57.41 
 
 		 269 aa  304  9.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  57.41 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  55.56 
 
 		 265 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  55.77 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  56.27 
 
 		 264 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  55.04 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  55.04 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  56.98 
 
 		 270 aa  285  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  55.08 
 
 		 258 aa  285  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  53.88 
 
 		 261 aa  281  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  53.03 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  54.44 
 
 		 259 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  53.1 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  54.02 
 
 		 262 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  53.26 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  48.85 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  47.88 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  50.76 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  48.65 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  49.42 
 
 		 257 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  49.42 
 
 		 257 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  46.33 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  49.05 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  49.23 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  49.81 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  47.53 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  49.62 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  49.23 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  47.08 
 
 		 459 aa  232  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 258 aa  232  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  49.23 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  49.24 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  46.18 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  48.85 
 
 		 261 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  47.53 
 
 		 275 aa  228  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  46.24 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  46.15 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  47.33 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  45.08 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  49.25 
 
 		 260 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  44.87 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  46.95 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  48.09 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  44.83 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  45.56 
 
 		 256 aa  222  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  46.95 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  46.95 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  45.45 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  44.94 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  43.85 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  49.24 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  45.35 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  45.21 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  48.85 
 
 		 287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  44.96 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  45.25 
 
 		 265 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  43.94 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  44.49 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  46.54 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  44.57 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  45.08 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  43.73 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  45.08 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  43.94 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  45.56 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  44.57 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  44.7 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>