More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02328 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  76.28 
 
 		 257 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  58.59 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  57.98 
 
 		 262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  56.03 
 
 		 262 aa  298  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  54.09 
 
 		 262 aa  295  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  54.86 
 
 		 262 aa  295  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  54.47 
 
 		 262 aa  295  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  54.09 
 
 		 262 aa  292  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  53.52 
 
 		 262 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  54.09 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  54.09 
 
 		 266 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  54.26 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  57.71 
 
 		 255 aa  288  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  53.7 
 
 		 283 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  53.7 
 
 		 283 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  53.7 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  53.73 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  53.31 
 
 		 266 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  53.49 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  52.92 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  53.15 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  54.9 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  51.76 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  52.96 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  53.75 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  53.75 
 
 		 255 aa  275  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  52.9 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  51.76 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  52.51 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  52.51 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  52.51 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  52.51 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  52.94 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  52.55 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  53.05 
 
 		 261 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  53.46 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  50.39 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  53.05 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  51.72 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  53.46 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  53.64 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  53.85 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  50.38 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  51.72 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  51.72 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  51.72 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  51.72 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  51.34 
 
 		 265 aa  268  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  53.05 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  51.37 
 
 		 269 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  51.34 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  51.34 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  51.37 
 
 		 269 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  51.34 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  51.37 
 
 		 269 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  52.69 
 
 		 260 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  51.37 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  51.76 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  50.78 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  51.16 
 
 		 262 aa  258  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  47.74 
 
 		 266 aa  258  9e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  53.88 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  53.67 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  49.02 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  53.88 
 
 		 260 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  49.02 
 
 		 255 aa  254  9e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  47.49 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  50.97 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  49.24 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  50.39 
 
 		 258 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  48.65 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  48.65 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  48.65 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  48.65 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  47.49 
 
 		 269 aa  241  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  49.8 
 
 		 258 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  48.65 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  48.65 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  48.65 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  48.08 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  48.08 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  48.08 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  48.26 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  48.08 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  48.08 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  48.08 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  48.08 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  47.88 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  49.41 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  47.08 
 
 		 265 aa  238  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  49.02 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  47.29 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  46.27 
 
 		 265 aa  235  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  47.84 
 
 		 282 aa  235  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  45.69 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  46.21 
 
 		 267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  45.19 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  45.83 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>