More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2610 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  100 
 
 		 262 aa  544  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  96.18 
 
 		 266 aa  527  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  95.42 
 
 		 266 aa  523  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  95.42 
 
 		 274 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  93.51 
 
 		 262 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  93.13 
 
 		 283 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  93.13 
 
 		 283 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  93.13 
 
 		 283 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  92.37 
 
 		 280 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  84.35 
 
 		 262 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  83.59 
 
 		 262 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  82.06 
 
 		 262 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  80.53 
 
 		 262 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  80.38 
 
 		 262 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  78.24 
 
 		 262 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  78.24 
 
 		 262 aa  434  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  56.59 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  57.31 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  54.94 
 
 		 256 aa  297  9e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  53.94 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  54.55 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  54.09 
 
 		 263 aa  292  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  52.36 
 
 		 255 aa  288  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  53.36 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  55.69 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  55.38 
 
 		 265 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  51.76 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  54.55 
 
 		 269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  54.55 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  54.55 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  55.38 
 
 		 265 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  55.38 
 
 		 265 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  55.38 
 
 		 265 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  51.38 
 
 		 255 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  54.75 
 
 		 264 aa  281  8.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  55 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  55 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  55 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  55 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  53.75 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1278  putative metallodependent hydrolase  55 
 
 		 265 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.558923  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  55 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  55 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  55 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1316  putative metallodependent hydrolase  55 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  hitchhiker  0.00000000025238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  55 
 
 		 265 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  53.46 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  53.73 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  53.33 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  52.69 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  53.33 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  50.39 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  53.33 
 
 		 261 aa  268  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  52.55 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  52.55 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  52.55 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  51.76 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  52.29 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  51.53 
 
 		 265 aa  259  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  53.33 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  53.33 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  53.33 
 
 		 260 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  49.23 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  48.26 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  46.06 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  46.06 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  47.88 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  46.86 
 
 		 267 aa  240  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  46.67 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  48.25 
 
 		 258 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  47.47 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2265  TatD family hydrolase  46.39 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  45.11 
 
 		 269 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  45.76 
 
 		 267 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  46.74 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  46.54 
 
 		 262 aa  232  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  46.72 
 
 		 257 aa  231  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  47.89 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  44.28 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  43.19 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  43.58 
 
 		 262 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  44.11 
 
 		 265 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  43.02 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  47.47 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  47.47 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  43.85 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  47.37 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  44.53 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  46.99 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  45.45 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  44.79 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  46.99 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  45.63 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  45.63 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  45.63 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  46.18 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  45.38 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  46.39 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  46.39 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>