More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1787 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  92.51 
 
 		 267 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  91.76 
 
 		 267 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  80.08 
 
 		 265 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  76.78 
 
 		 265 aa  424  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  65.15 
 
 		 254 aa  361  8e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  66.54 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  66.54 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  66.54 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  65.02 
 
 		 269 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  65.78 
 
 		 259 aa  353  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  60.98 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  65.78 
 
 		 259 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  65.4 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  65.02 
 
 		 263 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  67.18 
 
 		 262 aa  351  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  60.98 
 
 		 263 aa  349  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  65.02 
 
 		 260 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  65.02 
 
 		 260 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  64.26 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  63.12 
 
 		 257 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  64.26 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  64.26 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  64.26 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  64.26 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  64.26 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  63.88 
 
 		 263 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  64.26 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  61.85 
 
 		 265 aa  340  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  64.53 
 
 		 258 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  62.83 
 
 		 264 aa  337  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  63.67 
 
 		 258 aa  331  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  59.26 
 
 		 265 aa  328  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  59.63 
 
 		 269 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  59.26 
 
 		 269 aa  322  6e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  60.37 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  60.75 
 
 		 258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  58.97 
 
 		 290 aa  318  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  58.24 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  60.15 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  56.67 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  54.85 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  52.26 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  51.32 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  51.32 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  51.88 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  51.5 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  50.75 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  51.91 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  51.91 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  53.58 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  53.96 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  53.96 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  52.83 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  49.08 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  48.52 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  51.7 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  48.11 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  49.82 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  47.58 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  52.81 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  52.08 
 
 		 261 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  50.94 
 
 		 261 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  48.12 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  47.17 
 
 		 255 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  53.21 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  52.45 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  49.24 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  46.99 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  46.99 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  47.76 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  47.17 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  48.87 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  51.7 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  47.74 
 
 		 258 aa  238  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  44.91 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  45.11 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  47.94 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  45.76 
 
 		 259 aa  235  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  45.11 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  45.49 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  47.79 
 
 		 264 aa  234  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  45.9 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  47.51 
 
 		 459 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  47.06 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  43.91 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  47.41 
 
 		 275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  45.69 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  47.57 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  43.91 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  45.32 
 
 		 262 aa  231  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  44.28 
 
 		 280 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  46.1 
 
 		 269 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  46.1 
 
 		 269 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  46.1 
 
 		 269 aa  231  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  46.07 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  46.47 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0890  TatD family Mg-dependent DNase  45.35 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.621664  normal  0.629167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  44.57 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>