More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3114 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  63.26 
 
 		 271 aa  351  8e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  63.92 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  62.45 
 
 		 267 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  64.23 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  61.18 
 
 		 273 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  59.77 
 
 		 263 aa  322  5e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  58.53 
 
 		 263 aa  322  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  58.37 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  57.59 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  57.31 
 
 		 265 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  57.36 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  59.14 
 
 		 263 aa  313  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  59.14 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  57.75 
 
 		 260 aa  309  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  57.98 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  57.36 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  56.47 
 
 		 270 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  56.98 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  54.51 
 
 		 259 aa  295  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  54.9 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  54.51 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  55.86 
 
 		 265 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  55.43 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  53.33 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  50 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  54.86 
 
 		 263 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  55.08 
 
 		 257 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  54.44 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  52.92 
 
 		 266 aa  274  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  52.73 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  52.73 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  52.73 
 
 		 265 aa  272  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  51.91 
 
 		 267 aa  272  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  54.69 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  50.97 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  54.65 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  57.87 
 
 		 269 aa  265  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  50.59 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  48.64 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  51.55 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  53.26 
 
 		 263 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  48.43 
 
 		 254 aa  254  8e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  47.84 
 
 		 260 aa  254  9e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  55.31 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  46.59 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  47.58 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  45.53 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  47.69 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  47.19 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  46.18 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  46.64 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  47.15 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  49.22 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  52.16 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  46.07 
 
 		 267 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  46.33 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  48.83 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  50 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  50 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  48.44 
 
 		 258 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  45.77 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  46.42 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  45.66 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  45.66 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  43.58 
 
 		 255 aa  231  6e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41.9 
 
 		 257 aa  231  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  43.19 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  43.8 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  45.28 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  46.46 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  45.63 
 
 		 459 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  47.29 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  46.74 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  45.35 
 
 		 263 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  44.96 
 
 		 258 aa  228  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  47.67 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  46.24 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  45.8 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  46.92 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  47.88 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  47.08 
 
 		 262 aa  224  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  49.03 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  43.97 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  44.88 
 
 		 606 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  45.14 
 
 		 262 aa  222  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  47.27 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  44.09 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  46.88 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  46.72 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  47.27 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  46.72 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  45.35 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  46.72 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  47.49 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  47.88 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  47.49 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  46.54 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>