More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1463 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 267 aa  550  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  97.75 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  91.76 
 
 		 267 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  77.07 
 
 		 265 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  74.53 
 
 		 265 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  61.74 
 
 		 263 aa  360  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  61.74 
 
 		 263 aa  358  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  63.64 
 
 		 254 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  65.78 
 
 		 259 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  65.78 
 
 		 259 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  65.78 
 
 		 259 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  64.64 
 
 		 259 aa  349  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  64.64 
 
 		 260 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  64.64 
 
 		 259 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  64.64 
 
 		 260 aa  348  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  63.5 
 
 		 269 aa  348  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  62.59 
 
 		 265 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1942  hydrolase, TatD family  64.26 
 
 		 263 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.578111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  63.5 
 
 		 257 aa  346  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  63.88 
 
 		 263 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  62.74 
 
 		 269 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  62.74 
 
 		 269 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  62.74 
 
 		 269 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  62.74 
 
 		 269 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  62.74 
 
 		 269 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  62.74 
 
 		 269 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  62.74 
 
 		 269 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  64.5 
 
 		 262 aa  341  7e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  63.12 
 
 		 263 aa  341  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  63.02 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  58.89 
 
 		 265 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  60.97 
 
 		 264 aa  328  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  60 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  58.89 
 
 		 269 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  61.05 
 
 		 258 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  58.52 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3391  TatD family hydrolase  58.61 
 
 		 290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3409  TatD family hydrolase  59.26 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  58.27 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  57.14 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1008  TatD family hydrolase  55.19 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  54.1 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  52.63 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  51.32 
 
 		 255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  51.32 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  52.26 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  51.66 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  52.67 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  52.67 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  49.25 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  50.75 
 
 		 282 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  52.08 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  52.83 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  52.83 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  52.45 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  52.08 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  50.38 
 
 		 257 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  52.08 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  48.52 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  48.87 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  47.92 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  50.55 
 
 		 258 aa  251  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  48.12 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  47.37 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  51.7 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  52.45 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  44.74 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  51.13 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  51.32 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  44.91 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  49.06 
 
 		 258 aa  242  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  46.42 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  46.24 
 
 		 262 aa  241  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  46.62 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  47.96 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  46.99 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  46.07 
 
 		 268 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  47.39 
 
 		 262 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2800  putative metallodependent hydrolase  47.43 
 
 		 264 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.150723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  47.19 
 
 		 262 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  48.86 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  45.02 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  46.07 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  44.65 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  45.76 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2496  putative metallodependent hydrolase  46.69 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  47.57 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  45.76 
 
 		 262 aa  234  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  49.81 
 
 		 287 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  44.28 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  44.28 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  44.28 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  45.86 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  45.02 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  46.21 
 
 		 263 aa  232  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  45.02 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  46.84 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  45.49 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  45.39 
 
 		 262 aa  231  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  45.35 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>