More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0996 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  100 
 
 
263 aa  537  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  99.24 
 
 
263 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  88.8 
 
 
264 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  69.38 
 
 
259 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  73.54 
 
 
264 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  69.5 
 
 
260 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  69.11 
 
 
260 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  64.45 
 
 
257 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  63.53 
 
 
273 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  62.16 
 
 
267 aa  325  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  70.48 
 
 
228 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  59.14 
 
 
271 aa  315  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  60.77 
 
 
262 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  59.14 
 
 
268 aa  313  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  59.53 
 
 
263 aa  308  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  57.53 
 
 
263 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  57.53 
 
 
265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  59.07 
 
 
263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  56.86 
 
 
270 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  55.98 
 
 
270 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  57.25 
 
 
268 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  57.85 
 
 
263 aa  288  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  55.94 
 
 
263 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  56.25 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  55.47 
 
 
265 aa  278  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  54.09 
 
 
266 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  53.52 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  54.69 
 
 
265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  53.54 
 
 
265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  53.15 
 
 
265 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  49.81 
 
 
260 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  52.29 
 
 
267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  52.16 
 
 
265 aa  268  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  53.94 
 
 
265 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  50.39 
 
 
267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  48.05 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  45.95 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  47.84 
 
 
259 aa  251  9.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  47.29 
 
 
258 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  47.45 
 
 
260 aa  249  2e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  45.88 
 
 
258 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  53.26 
 
 
263 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  52.36 
 
 
269 aa  242  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  48.05 
 
 
255 aa  238  1e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  47.88 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  46.36 
 
 
258 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  43.08 
 
 
268 aa  229  4e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  45.8 
 
 
257 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2516  TatD-related deoxyribonuclease  45.42 
 
 
265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11024  normal  0.0103613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.05 
 
 
459 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  46.33 
 
 
270 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  43.77 
 
 
261 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  45.31 
 
 
254 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  45.04 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  44.7 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  47.13 
 
 
262 aa  214  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  44.7 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  41.09 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  44.75 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  41.09 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  44.32 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  41.47 
 
 
258 aa  211  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  43.58 
 
 
262 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  43.53 
 
 
261 aa  211  9e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  44.66 
 
 
257 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  44.66 
 
 
257 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  44.14 
 
 
260 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  45.04 
 
 
258 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  42.35 
 
 
259 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  43.24 
 
 
255 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  43.24 
 
 
255 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.24 
 
 
255 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.24 
 
 
255 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.24 
 
 
255 aa  208  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  42.64 
 
 
255 aa  208  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  44.23 
 
 
264 aa  208  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  44.14 
 
 
260 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  44.96 
 
 
265 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  44.14 
 
 
260 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  42.01 
 
 
267 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.86 
 
 
255 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  42.8 
 
 
262 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  44.96 
 
 
265 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  44.96 
 
 
265 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  42.86 
 
 
255 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  44.96 
 
 
265 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  44.96 
 
 
265 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  44.96 
 
 
265 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  41.79 
 
 
267 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  44.96 
 
 
265 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  46.51 
 
 
261 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  44.96 
 
 
265 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  40.94 
 
 
257 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  44.96 
 
 
265 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  42.86 
 
 
255 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  41.79 
 
 
267 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  42.59 
 
 
262 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  42.08 
 
 
256 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.08 
 
 
255 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>