More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4186 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  100 
 
 		 265 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  99.25 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  97.36 
 
 		 265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  79.92 
 
 		 266 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  69.53 
 
 		 268 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  69.53 
 
 		 270 aa  349  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  61.63 
 
 		 267 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  55.86 
 
 		 271 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  54.69 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  60.55 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  54.05 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  57.14 
 
 		 273 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  56.03 
 
 		 267 aa  281  9e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  55.47 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  54.41 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  55.47 
 
 		 263 aa  278  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  55.08 
 
 		 259 aa  278  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  53.41 
 
 		 267 aa  278  6e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  55.68 
 
 		 270 aa  278  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  53.52 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  51.95 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  57.42 
 
 		 263 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  55.6 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  52.73 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  55.98 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  55.77 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  54.69 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  53.91 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  52.14 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  52.11 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  55 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  55.38 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  52.9 
 
 		 257 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  50.78 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  51.91 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  48.26 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  45.91 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  46.12 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  45.17 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  46.9 
 
 		 258 aa  225  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  41.86 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  52.44 
 
 		 228 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  42.15 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  45.7 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  43.24 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  43.87 
 
 		 459 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  43.41 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  46.74 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  41.25 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  45.77 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  42.48 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  39.22 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  47.73 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  45.38 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2202  hypothetical protein  45.98 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  44.23 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  45 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  39.23 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  42.91 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  45.21 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  41.35 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  44.79 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  39.23 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  44.79 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  43.19 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  43.19 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  40.44 
 
 		 269 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  42.48 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  42.8 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  43.41 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  40.55 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  42.02 
 
 		 260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  42.02 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  41.57 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  40.31 
 
 		 265 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  40.23 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  44.92 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  42.05 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1594  putative metallodependent hydrolase  42.41 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  40.81 
 
 		 269 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  43.92 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  40.38 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  43.41 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  38.87 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.8 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  39.85 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  42.37 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  39.23 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  40.93 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  40.44 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2157  TatD family hydrolase  41 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  38.76 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  39.47 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  36.82 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  37.64 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  36.82 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1881  TatD family hydrolase  42.69 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0796453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1636  TatD family hydrolase  41.06 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>