More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0066 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  100 
 
 		 257 aa  533  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  59.06 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  51.57 
 
 		 256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  52.36 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  52.36 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  52.36 
 
 		 255 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  52.36 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  52.36 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  52.36 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  52.57 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  51.97 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  51.18 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  51.97 
 
 		 255 aa  285  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  51.57 
 
 		 255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  51.57 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  51.18 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  52.57 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  49.8 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  50.2 
 
 		 606 aa  265  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  50.79 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  48.03 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  50 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  46.69 
 
 		 464 aa  258  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  47.62 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  46.67 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  46.67 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  47.64 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  47.06 
 
 		 462 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  45.49 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  48.24 
 
 		 462 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  49.41 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  47.06 
 
 		 458 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  46.67 
 
 		 458 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  45.45 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  42.52 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  46.27 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  46.27 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  46.22 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  44.23 
 
 		 262 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  43.36 
 
 		 457 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  46.67 
 
 		 461 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  46.46 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  44.84 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  44.05 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  45 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  46.09 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  44.66 
 
 		 459 aa  225  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  44.09 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  44.15 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  42.75 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  45.85 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  40.64 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  40.86 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  39.04 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  41.63 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  43.41 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  44.66 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  45.21 
 
 		 262 aa  218  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  40.71 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  42.08 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  44.27 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  41.11 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  46.15 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  44.19 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  43.8 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  41.41 
 
 		 255 aa  214  9e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  39.68 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  43.08 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  42.35 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  45.7 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  46.54 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  46.54 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  41.44 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  43.58 
 
 		 262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  41.34 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  41.18 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  43.41 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  40.23 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  44.49 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  43.36 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  43.02 
 
 		 283 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  43.02 
 
 		 283 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  43.02 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  43.02 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  42.53 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  45.77 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  43.02 
 
 		 283 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 265 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  42.29 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  41.7 
 
 		 263 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  43.46 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  42.58 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  36.8 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  43.02 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  42.21 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  42.64 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  43.97 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  41.22 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  42.15 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  42.01 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>