More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3900 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  100 
 
 		 262 aa  544  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  51.54 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  46.15 
 
 		 256 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  45.38 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  44.79 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  44.23 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  43.85 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  43.68 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  43.68 
 
 		 255 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  43.68 
 
 		 255 aa  231  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.68 
 
 		 255 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  43.68 
 
 		 255 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  45.98 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  43.3 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  43.3 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  42.91 
 
 		 256 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  42.91 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  40.93 
 
 		 263 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  42.91 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  40.46 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.91 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.25 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  45.8 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  41.09 
 
 		 464 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  41.38 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  46.69 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  39.38 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  40.93 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  42.41 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.08 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  44.27 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  42.02 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  39.77 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  42.69 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40 
 
 		 457 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  39 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  36.78 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  37.55 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  38.46 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  38.85 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  39.46 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  37.55 
 
 		 606 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  37.55 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  37.55 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  37.55 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  37.02 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  39.08 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  40 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  39.77 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  36.12 
 
 		 462 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  36.26 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  35.61 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  38.93 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  35.91 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  40.31 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  35.11 
 
 		 461 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  36.86 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  38.46 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  40.42 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  36.02 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  37.74 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  33.59 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  39.39 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.52 
 
 		 459 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  36.5 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  37.45 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  37.16 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  35.25 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  38.61 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  34.34 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1045  TatD family hydrolase  34.85 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  35.63 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  37.26 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  38.31 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1083  TatD-related deoxyribonuclease  37.69 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  35.5 
 
 		 458 aa  181  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  33.98 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  39.77 
 
 		 259 aa  181  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  34.11 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  34.96 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  34.96 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  34.96 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.87 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  34.5 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  39.02 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.11 
 
 		 458 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0357  TatD family hydrolase  33.72 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  35.88 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  34.47 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  33.83 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  33.83 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  33.83 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  33.83 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  33.83 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>