More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0468 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  46.77 
 
 
458 aa  244  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  47.15 
 
 
458 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  49.61 
 
 
462 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  44.19 
 
 
464 aa  235  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  44.4 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  46.12 
 
 
606 aa  231  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  50.77 
 
 
259 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  50.58 
 
 
258 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  42.64 
 
 
462 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  50.58 
 
 
258 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  50.58 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  45.17 
 
 
457 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  41.18 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  47.51 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  46.39 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  42.8 
 
 
256 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  46.33 
 
 
261 aa  218  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  43.41 
 
 
257 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  45.14 
 
 
260 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  43.19 
 
 
256 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  43.8 
 
 
259 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  41.86 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  40.23 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  41.63 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  39.16 
 
 
264 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.25 
 
 
255 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  44.79 
 
 
258 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  41.25 
 
 
255 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  42.8 
 
 
459 aa  209  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  40.86 
 
 
255 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  40.86 
 
 
255 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  40.86 
 
 
255 aa  208  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  40.86 
 
 
255 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  45.77 
 
 
257 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  44.19 
 
 
260 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  40.47 
 
 
255 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.25 
 
 
255 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  41.25 
 
 
255 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  40.86 
 
 
255 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  44.92 
 
 
257 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  44.92 
 
 
257 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  47.49 
 
 
270 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  42.91 
 
 
265 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  39.69 
 
 
256 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  42.8 
 
 
267 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  43.58 
 
 
264 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  41.44 
 
 
271 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  40.47 
 
 
256 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  43.41 
 
 
461 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  42.02 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  45.08 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  43.51 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  43.51 
 
 
263 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  42.53 
 
 
263 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  43.51 
 
 
263 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  43.4 
 
 
262 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  41.31 
 
 
265 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  42.35 
 
 
257 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  41.7 
 
 
256 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  42.75 
 
 
256 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  43.08 
 
 
262 aa  198  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  44.36 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  42.21 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  47.29 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  42.97 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  42.42 
 
 
264 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  42.53 
 
 
258 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  38.74 
 
 
265 aa  196  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  43.8 
 
 
265 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  40.54 
 
 
255 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  43.77 
 
 
269 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  43.3 
 
 
262 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  42.15 
 
 
258 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  41.02 
 
 
263 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.15 
 
 
255 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  43.77 
 
 
269 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  43.77 
 
 
269 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  44.19 
 
 
267 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1752  hydrolase, TatD family  41.29 
 
 
265 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  41.83 
 
 
263 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1779  hydrolase, TatD family  41.29 
 
 
265 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  42.64 
 
 
273 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.93 
 
 
258 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  42.97 
 
 
265 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  36.29 
 
 
256 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  41.31 
 
 
259 aa  191  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  43.58 
 
 
273 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  37.31 
 
 
258 aa  191  8e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  44.36 
 
 
270 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  42.91 
 
 
267 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  36.29 
 
 
256 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1984  putative metallodependent hydrolase  41.6 
 
 
265 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000140367  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  40.84 
 
 
265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2167  putative metallodependent hydrolase  41.6 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  hitchhiker  0.000000000251924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  40.84 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  41.06 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1301  putative metallodependent hydrolase  41.6 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0214431  hitchhiker  0.0000000000156726 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  40.84 
 
 
265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  40.84 
 
 
265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>